Seminar Medizinische Visualisierung

  Organisatorisches    
SS 2006,  (Sonstige Veranstaltung), 
2S (Vorlesungen + Übungen)
Dozenten: Rößler  
Hub  
Ertl  
Termine: Mi   14:00  -  15:30    in 0.363   Seminar
  Wichtige Hinweise    
Vorbesprechung
Die Vorbesprechung war am 15.2.2006. Die Folien gibt es hier.
  Beschreibung    
image1 image2 image3
Bildgebende Verfahren in der Medizin ermöglichen detaillierte Diagnosen und die Optimierung von Therapien. Außerdem können sie für die Planung und interaktive Kontrolle von Operationen eingesetzt werden. Um dies zu ermöglichen, müssen die gewonnenen Daten geeignet aufbereitet und dargestellt werden. Hierfür bietet die medizinische Bildverarbeitung und Visualisierung verschiedene Methoden an.

Die Themen sind:

1.Titel:Bildgebende Verfahren in der Medizin
Referenzen: K. Erich: Bildgebende Systeme für die medizinische Diagnostik
O. Dössel: Bildgebende Verfahren in der Medizin
T. Lehmann: Bildverarbeitung für die Medizin
Vortragender: Christian Demler
Termin:26.04.2006
Betreuer:Andreas Hub
Folien: pdf
Ausarbeitung:   
 
2.Titel:Oberflächenrekonstruktion
Referenzen: Lorensen, Cline: Marching cubes: a high resolution 3D surface construction algorithm, SIGGRAPH, 1987
Bade et al.: Comparison of Fundamental Mesh Smoothing Algorithms for Medical Surface Models, SimVis, 2006
Hauptpaper: Fenchel et al.: Dynamic Surface Reconstruction from 4D-MR Images, VMV, 2005
Vortragender: Hannes Wolf
Termin:10.05.2005
Betreuer:Friedemann Rößler
Folien:pdf
Ausarbeitung:pdf
 
3.Titel:Registrierung
Vortragender: Frank Enders
Termin:17.05.2006
 
4.Titel:Direkte Volumenvisualisierung
Referenzen: Pfister, H.: Moderne Volumenvisualisierung, Information Technology, Heft 3/2004 (June)
Engel et al.: Real Time Volume Graphics, Course 28, Siggraph 2004 (Link ...)
Vega et al.: Smooth Volume Rendering of Labeled Medical Data on Consumer Graphics Hardware, SPIE Medical Imaging, 2005
Hauptpaper: Vega et al.: High Performance Volume Splatting for Visualization of Neurovascular Data, IEEE Visualization 2005
Vortragender: Alexander Lauser
Termin:24.05.2006
Betreuer:Friedemann Rößler
Folien: pdf
Ausarbeitung: pdf
 
5.Titel:Illustrative medizinische Visualisierung
Referenzen: Viola et al.: IEEE Visualization Tutorial on Illustrative Visualization, IEEE Visualization 2005, (Link ...)
Preim et al.: NPR, Focussing and Emphasis in Medical Visualizations, SimVis, 2005
Bruckner et al.: Illustrative Context-Preserving Volume Rendering, EuroVis, 2005
Hauptpaper: Bruckner et al.: VolumeShop: An Interactive System for Direct Volume Illustration, IEEE Visualization, 2005
Vortragender: Michael Ott
Termin:31.05.2006
Betreuer:Friedemann Rößler
Folien: pdf
Ausarbeitung: pdf
 
6.Titel:Gefäßvisualisierung
Referenzen: T. Lehmann: Bildverarbeitung für die Medizin
Hauptpaper: K. Bühler, P. Felkel, A. La Cruz: Geometric Methods for Vessel Visualization and Quantification - A Survey.
In: G. Brunnet, B. Hamann, H. Müller (Ed.), Geometric Modeling for Scientific Visualization, S. 399-420, Springer 2004
Vortragende: Edmund Wolf
Termin:14.06.2006
Betreuer:Andreas Hub
Folien:
Ausarbeitung:   
 
7.Titel:Diffusions-Tensor-Visualisierung
Referenzen: Kolecki.: An introduction to tensors for students of physics and engineering
Zheng, Pang: Volume deformation for tensor visualization
Delmarcelle, Hesselink: Visualizing second-order tensor fields with hyperstreamlines
Hauptpaper: Peeters et al.: Visualization of the Fibrous Structure of the Heart
Vortragender: Joachim Schwarz
Termin:28.06.2006
Betreuer:Andreas Hub
Folien:
Ausarbeitung:
 
8.Titel:Modellierung und Visualisierung des Herzens
Referenzen: Masood et al.: Investigating Intrinsic Myocardial Mechanics: The Role of MR Tagging, Velocity Phase Mapping, and Diffusion Imaging, Journal of Magnetic Resonance Imaging 12, 2000
Park et al.: Volumetric Heart Modelling and Analysis, Communications of the ACM, 43, 2, 2005
Sermesant et al.: Progress towards an Elctro-Mechanical Model of the Heart for Cardiac Image Analysis, IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI) 2002
Hauptpaper: Sermesant et al.: An Electromechanical Model of the Myocardium for Cardiac Image Analysis and Medical Simulation, Research Report 5395, INRIA, 2004
Vortragende: Viet Long Dang
Termin:5.07.2006
Betreuer:Friedemann Rößler
Folien: pdf
Ausarbeitung: pdf
 
9.Titel:Virtuelle Chirurgie
Referenzen: H. Delingette and N. Ayache. Hepatic Surgery Simulation, Communications of the ACM, 48(2):31-36, February 2005
Hauptpaper: D. Bartz et al.: Hybrid Segmentation and Exploration of the Human Lungs, Proceedings of the 14th IEEE Visualization Conference (VIS’03), 177-184
Vortragender: N.N.
Termin:12.07.2005 Entfallen!!
Betreuer:Andreas Hub
Folien:
Ausarbeitung:   
 
10.Titel:Segmentierung
Referenzen: Lehmann et al., Bildverarbeitung für die Medizin, Springer, 1997
Yoo, Insight Into Images, A K Peters, 2004
Cootes et al.: Active Shape Models - Their Training and Application, Computer Vision and Image Understanding, 1995
Cootes and Taylor: A Mixture Model for Representing Shape Variation, Image and Vision Computing, 1999
Hauptpaper: Van Ginneken et al.: Active Shape Model Segmentation With Optimal Features, IEEE Transactions on Medical Imaging, 2002
Vortragender: Fabian Schick
Termin:19.07.2005
Betreuer:Friedemann Rößler / Andreas Hub
Folien:
Ausarbeitung:
 

  Literatur    
1.  Bildgebende Verfahren in der Medizin, Olaf Dössel, Springer Verlag, 1997, Von der technik zur medizinischen Anwendung
2.  Bildgebende Systeme für die medizinische Diagnostik , Erich Krestel, Siemens AG, 1988, Grundlagen u. techn. Lösungen
3.  Bildverarbeitung für die Medizin, Thomas Lehmann, Springer Verlag, 1998
4.  Volumetric Image Analysis, Gabriele Lohmann, Wiley & Teubner, 1998
5.  Computer graphics : principles and practice , Foley, James D.; Van Dam, Andries; Feiner, Steven K.; Hughes, John F., Addison-Wesley, 1990
6.  Virtual Endoscopy and Related 3D Techniques, Patrick Rogolla, Springer Verlag, 2002
  Sonstiges    

Deadlines

Mindestens 2 Wochen vor dem eigenen Vortrag:

  • Reicht der Teilnehmer ein HTML-Dokument bei den Betreuern ein, das als Vortragsankündigung dient und dem Leser einen Einstieg in das Thema ermöglicht. Das Dokument sollte Links zu weiteren Quellen zum Thema bieten, damit die anderen Seminarteilnehmer sich auf den Vortrag vorbereiten können. Vorlage.
  • Hält der Vortragende Rücksprache mit den Betreuern über die Gliederung des Vortrages und der Zusammenfassung; dazu werden die fertigen Vortragsfolien benötigt.

Mindestens 1 Woche vor dem eigenen Vortrag:

  • Fertige Vortragsfolien

Direkt nach dem Vortrag gibt der Vortragende seine Folien bei den Betreuern in elektronischer Form ab (Source-File und einseitige PostScript oder PDF-Datei)

Innerhalb von 4 Wochen nach dem Vortrag und spätestens Ende Juli gibt der Vortragende seine Ausarbeitung in elektronischer Form (Source-File und einseitige PostScript- oder PDF-Datei) bei den Betreuern ab.

Ausarbeitung und Vortrag

Für die schriftliche Zusammenfassung zum vorgetragenen Thema steht eine LaTeX-Vorlage, eine Word-Vorlage und eine OpenOffice-Vorlage und eine zur Verfügung, entweder auf VIS-Maschinen unter /proj/vis/templates/tex/ oder hier zu finden ist.

Für den Vortrag wird ein Beamer und ein LapTop mit Powerpoint zur Verfügung stehen. Zur Erstellung der Folien stellen wir ein Power Point und ein OpenOffice bereit.

Hier noch ein paar Links zu Hinweisen, worauf bei einem Vortrag zu achten ist:

Es gibt im Web unzählige Dokumente, die solche Hinweise und Tipps enthalten. Alle Angaben zum Umfang von Vortrag und Seminararbeit aus diesen Hinweisen sind natürlich zu ignorieren...!


»Stundenplanübersicht«   »Listenübersicht«